东莞市气候局现为正处级单位，实施上级主管组织与本级政府双重领导的管理体制，首要担任气候勘探、预告、服务和气候灾祸防护、气候资源使用、雷电防护、气候科学技术讨论研讨等作业。下设功能科室3个：办公室、行政法律办公室、事务科。直属单位4个：气候台、防雷设备检测所、科技信息服务中心、人工影响气候办公室。现在人工影响气候作业并未运转。
现在东莞气候观测项目已由惯例的降水量、气压、气温、湿度、能见度、风等基础上，增加了16个归纳勘探项目，气候观测从传统气候观测，拓宽到气候、生态、城市、大气环境、水位、雷电等多个范畴，建成了归纳立体多要素观测网。2008年3月，东莞市气候事务归纳勘探基地启用，由“点”、“片”、“面”组成的气候事务归纳观测系统初具雏形。（“点”指气候事务归纳勘探基地；“片”指五个气候生态站、“面”指遍及全市的98个中标准主动气候站。）
东莞气候局对外发布长、中、短期气候预告。长时间预告以月报为主，兼发前、后汛期气候趋势猜测。中期预告以周报为主。短期气候预告细分为12小时，即对外发布白日、黑夜时段的气候预告。
东莞气候局建立了“四大服务结构”：决议计划与保证服务、大众气候服务、专业服务和专项服务等气候科技服务，并下设影视制作组织，逐渐构建出一个日趋完善、开放式的公共气候服务系统，产品服务触及大众日子、职业出产、政府部门决议计划、重要时节、严重节日、严重社会政治经济活动等的气候保证服务。防雷部分则由防雷设备检测所担任。服务手法包含：大众气候网站、电话答询渠道、气候影视节目、手机短信息、报纸专版、防雷检测等。
